X‐chromosome-wide association study for Alzheimer’s disease
Julie Le Borgne
(1)
,
Lissette Gomez
,
Sami Heikkinen
,
Najaf Amin
,
Shahzad Ahmad
,
Seung Hoan Choi
,
Joshua Bis
,
Benjamin Grenier-Boley
,
Omar Garcia Rodriguez
,
Luca Kleineidam
,
Juan Young
,
Kumar Parijat Tripathi
,
Lily Wang
,
Achintya Varma
,
Rafael Campos-Martin
,
Sven van der Lee
,
Vincent Damotte
,
Itziar de Rojas
,
Sagnik Palmal
,
Richard Lipton
,
Eric Reiman
,
Ann Mckee
,
Philip de Jager
,
William Bush
,
Scott Small
,
Allan Levey
,
Andrew Saykin
,
Tatiana Foroud
,
Marilyn Albert
,
Bradley Hyman
,
Ronald Petersen
,
Steven Younkin
,
Mary Sano
,
Thomas Wisniewski
,
Robert Vassar
,
Julie Schneider
,
Victor Henderson
,
Erik Roberson
,
Charles Decarli
,
Frank Laferla
,
James Brewer
,
Russell Swerdlow
,
Linda van Eldik
,
Kara Hamilton-Nelson
,
Henry Paulson
,
Adam Naj
,
Oscar Lopez
,
Helena Chui
,
Paul Crane
,
Thomas Grabowski
,
Walter Kukull
,
Sanjay Asthana
,
Suzanne Craft
,
Stephen Strittmatter
,
Carlos Cruchaga
,
James Leverenz
,
Alison Goate
,
M. Ilyas Kamboh
,
Peter St George-Hyslop
,
Otto Valladares
,
Amanda Kuzma
,
Laura Cantwell
,
Matthias Riemenschneider
,
John Morris
,
Susan Slifer
,
Carolina Dalmasso
,
Atahualpa Castillo
,
Fahri Küçükali
,
Oliver Peters
,
Anja Schneider
,
Martin Dichgans
,
Dan Rujescu
,
Norbert Scherbaum
,
Jürgen Deckert
,
Steffi Riedel-Heller
,
Lucrezia Hausner
,
Laura Molina-Porcel
,
Emrah Düzel
,
Timo Grimmer
,
Jens Wiltfang
,
Stefanie Heilmann-Heimbach
,
Susanne Moebus
,
Thomas Tegos
,
Nikolaos Scarmeas
,
Oriol Dols-Icardo
,
Fermin Moreno
,
Jordi Pérez-Tur
,
María J Bullido
,
Pau Pastor
,
Raquel Sánchez-Valle
,
Victoria Álvarez
,
Mercè Boada
,
Pablo García-González
,
Raquel Puerta
,
Pablo Mir
,
Luis M Real
,
Gerard Piñol-Ripoll
,
Jose María García-Alberca
,
Jose Luís Royo
,
Eloy Rodriguez-Rodriguez
,
Hilkka Soininen
,
Alexandre de Mendonça
,
Shima Mehrabian
,
Latchezar Traykov
,
Jakub Hort
,
Martin Vyhnalek
,
Jesper Qvist Thomassen
,
Yolande a L Pijnenburg
,
Henne Holstege
,
John van Swieten
,
Inez Ramakers
,
Frans Verhey
,
Philip Scheltens
,
Caroline Graff
,
Goran Papenberg
,
Vilmantas Giedraitis
,
Anne Boland
(2)
,
Jean-François Deleuze
(2)
,
Gael Nicolas
,
Carole Dufouil
,
Florence Pasquier
,
Olivier Hanon
,
Stéphanie Debette
(3)
,
Edna Grünblatt
,
Julius Popp
,
Roberta Ghidoni
,
Daniela Galimberti
,
Beatrice Arosio
,
Patrizia Mecocci
,
Vincenzo Solfrizzi
,
Lucilla Parnetti
,
Alessio Squassina
,
Lucio Tremolizzo
,
Barbara Borroni
,
Benedetta Nacmias
,
Marco Spallazzi
,
Davide Seripa
,
Innocenzo Rainero
,
Antonio Daniele
,
Paola Bossù
,
Carlo Masullo
,
Giacomina Rossi
,
Frank Jessen
,
Victoria Fernandez
,
Patrick Gavin Kehoe
,
Ruth Frikke-Schmidt
,
Magda Tsolaki
,
Pascual Sánchez-Juan
,
Kristel Sleegers
,
Martin Ingelsson
,
Jonathan Haines
,
Lindsay Farrer
,
Richard Mayeux
,
Li-San Wang
,
Rebecca Sims
,
Anita Destefano
,
Gerard D Schellenberg
,
Sudha Seshadri
,
Philippe Amouyel
,
Julie Williams
,
Wiesje van der Flier
,
Alfredo Ramirez
,
Margaret Pericak-Vance
,
Ole A Andreassen
,
Cornelia van Duijn
,
Mikko Hiltunen
,
Agustín Ruiz
,
Josée Dupuis
,
Eden Martin
,
Jean-Charles Lambert
,
Brian Kunkle
,
Céline Bellenguez
Lissette Gomez
- Fonction : Auteur
Sami Heikkinen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1372241
- ORCID : 0000-0002-6083-2402
Najaf Amin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305533
- ORCID : 0000-0002-8944-1771
Shahzad Ahmad
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305532
- ORCID : 0000-0002-8658-3790
Seung Hoan Choi
- Fonction : Auteur
Joshua Bis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305537
- ORCID : 0000-0002-3409-1110
Benjamin Grenier-Boley
- Fonction : Auteur
Omar Garcia Rodriguez
- Fonction : Auteur
Luca Kleineidam
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497014
- ORCID : 0009-0006-3309-6856
Juan Young
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497015
- ORCID : 0000-0002-3923-6016
Kumar Parijat Tripathi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497016
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Lily Wang
- Fonction : Auteur
Achintya Varma
- Fonction : Auteur
Rafael Campos-Martin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497017
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Sven van der Lee
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305560
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Vincent Damotte
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305704
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Itziar de Rojas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305569
- ORCID : 0000-0002-2148-381X
Sagnik Palmal
- Fonction : Auteur
Richard Lipton
- Fonction : Auteur
Eric Reiman
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497018
- ORCID : 0000-0002-0705-3696
Ann Mckee
- Fonction : Auteur
Philip de Jager
- Fonction : Auteur
William Bush
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305627
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Scott Small
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497019
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Allan Levey
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497020
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Andrew Saykin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1216245
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Tatiana Foroud
- Fonction : Auteur
Marilyn Albert
- Fonction : Auteur
Bradley Hyman
- Fonction : Auteur
Ronald Petersen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497021
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Steven Younkin
- Fonction : Auteur
Mary Sano
- Fonction : Auteur
Thomas Wisniewski
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497022
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Robert Vassar
- Fonction : Auteur
Julie Schneider
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497023
- ORCID : 0000-0002-9482-1752
Victor Henderson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497024
- ORCID : 0000-0003-1198-9240
Erik Roberson
- Fonction : Auteur
Charles Decarli
- Fonction : Auteur
Frank Laferla
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497025
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James Brewer
- Fonction : Auteur
Russell Swerdlow
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497026
- ORCID : 0000-0003-2948-7230
Linda van Eldik
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497027
- ORCID : 0000-0002-8139-6400
Kara Hamilton-Nelson
- Fonction : Auteur
Henry Paulson
- Fonction : Auteur
Adam Naj
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305549
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Oscar Lopez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305656
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Helena Chui
- Fonction : Auteur
Paul Crane
- Fonction : Auteur
Thomas Grabowski
- Fonction : Auteur
Walter Kukull
- Fonction : Auteur
Sanjay Asthana
- Fonction : Auteur
Suzanne Craft
- Fonction : Auteur
Stephen Strittmatter
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497028
- ORCID : 0000-0001-8188-3092
Carlos Cruchaga
- Fonction : Auteur
James Leverenz
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497029
- ORCID : 0000-0002-0896-0749
Alison Goate
- Fonction : Auteur
- PersonId : 761457
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M. Ilyas Kamboh
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497030
- ORCID : 0000-0002-3453-1438
Peter St George-Hyslop
- Fonction : Auteur
Otto Valladares
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305680
- ORCID : 0000-0001-8055-2187
Amanda Kuzma
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497031
- ORCID : 0000-0002-6064-5420
Laura Cantwell
- Fonction : Auteur
Matthias Riemenschneider
- Fonction : Auteur
John Morris
- Fonction : Auteur
Susan Slifer
- Fonction : Auteur
Carolina Dalmasso
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305631
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Atahualpa Castillo
- Fonction : Auteur
Fahri Küçükali
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305572
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Oliver Peters
- Fonction : Auteur
Anja Schneider
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497032
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Martin Dichgans
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1274892
- ORCID : 0000-0002-0654-387X
Dan Rujescu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305707
- ORCID : 0000-0002-1432-313X
Norbert Scherbaum
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497033
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Jürgen Deckert
- Fonction : Auteur
Steffi Riedel-Heller
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305554
- ORCID : 0000-0003-4321-6090
Lucrezia Hausner
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497034
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Laura Molina-Porcel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497035
- ORCID : 0000-0003-4068-8578
Emrah Düzel
- Fonction : Auteur
Timo Grimmer
- Fonction : Auteur
Jens Wiltfang
- Fonction : Auteur
- PersonId : 776430
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Stefanie Heilmann-Heimbach
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1192196
- ORCID : 0000-0003-1057-465X
Susanne Moebus
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1372164
- ORCID : 0000-0002-0072-5410
Thomas Tegos
- Fonction : Auteur
Nikolaos Scarmeas
- Fonction : Auteur
Oriol Dols-Icardo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305535
- ORCID : 0000-0003-2656-8748
Fermin Moreno
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497036
- ORCID : 0000-0001-5200-3164
Jordi Pérez-Tur
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1252156
- ORCID : 0000-0002-9111-1712
María J Bullido
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305640
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Pau Pastor
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305551
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Raquel Sánchez-Valle
- Fonction : Auteur
Victoria Álvarez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1358660
- ORCID : 0000-0002-1916-2523
Mercè Boada
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305621
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Pablo García-González
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305580
- ORCID : 0000-0003-0125-5403
Raquel Puerta
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305667
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Pablo Mir
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1370362
- ORCID : 0000-0003-1656-302X
Luis M Real
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305669
- ORCID : 0000-0003-4932-7429
Gerard Piñol-Ripoll
- Fonction : Auteur
Jose María García-Alberca
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305642
- ORCID : 0000-0003-2951-6644
Jose Luís Royo
- Fonction : Auteur
Eloy Rodriguez-Rodriguez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305587
- ORCID : 0000-0001-7742-677X
Hilkka Soininen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763717
- ORCID : 0000-0002-2785-9937
Alexandre de Mendonça
- Fonction : Auteur
Shima Mehrabian
- Fonction : Auteur
Latchezar Traykov
- Fonction : Auteur
Jakub Hort
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305705
- ORCID : 0000-0002-1080-3726
Martin Vyhnalek
- Fonction : Auteur
Jesper Qvist Thomassen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305668
- ORCID : 0000-0003-3484-9531
Yolande a L Pijnenburg
- Fonction : Auteur
Henne Holstege
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305529
- ORCID : 0000-0002-7688-3087
John van Swieten
- Fonction : Auteur
Inez Ramakers
- Fonction : Auteur
Frans Verhey
- Fonction : Auteur
Philip Scheltens
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1360442
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Caroline Graff
- Fonction : Auteur
Goran Papenberg
- Fonction : Auteur
Vilmantas Giedraitis
- Fonction : Auteur
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Anne Boland
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757786
- ORCID : 0000-0001-8789-5676
Gael Nicolas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 178691
- IdHAL : gael-nicolas1
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- IdRef : 165828412
Carole Dufouil
- Fonction : Auteur
- PersonId : 759932
- ORCID : 0000-0003-2442-4476
Florence Pasquier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1163029
- ORCID : 0000-0001-9880-9788
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Olivier Hanon
- Fonction : Auteur
Stéphanie Debette
- Fonction : Auteur
- PersonId : 759687
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- IdRef : 104485833
Edna Grünblatt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1256800
- ORCID : 0000-0001-8505-7265
Julius Popp
- Fonction : Auteur
Roberta Ghidoni
- Fonction : Auteur
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Daniela Galimberti
- Fonction : Auteur
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Beatrice Arosio
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497038
- ORCID : 0000-0002-0615-3580
Patrizia Mecocci
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1497039
- ORCID : 0000-0003-0729-5246
Vincenzo Solfrizzi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305675
- ORCID : 0000-0002-8524-0315
Lucilla Parnetti
- Fonction : Auteur
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Alessio Squassina
- Fonction : Auteur
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Lucio Tremolizzo
- Fonction : Auteur
Barbara Borroni
- Fonction : Auteur
Benedetta Nacmias
- Fonction : Auteur
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Marco Spallazzi
- Fonction : Auteur
Davide Seripa
- Fonction : Auteur
Innocenzo Rainero
- Fonction : Auteur
Antonio Daniele
- Fonction : Auteur
Paola Bossù
- Fonction : Auteur
- PersonId : 799767
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Carlo Masullo
- Fonction : Auteur
Giacomina Rossi
- Fonction : Auteur
Frank Jessen
- Fonction : Auteur
Victoria Fernandez
- Fonction : Auteur
Patrick Gavin Kehoe
- Fonction : Auteur
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Ruth Frikke-Schmidt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305693
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Magda Tsolaki
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305692
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Pascual Sánchez-Juan
- Fonction : Auteur
Kristel Sleegers
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305594
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Martin Ingelsson
- Fonction : Auteur
Jonathan Haines
- Fonction : Auteur
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Lindsay Farrer
- Fonction : Auteur
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Richard Mayeux
- Fonction : Auteur
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Li-San Wang
- Fonction : Auteur
Rebecca Sims
- Fonction : Auteur
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Anita Destefano
- Fonction : Auteur
Gerard D Schellenberg
- Fonction : Auteur
Sudha Seshadri
- Fonction : Auteur
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Philippe Amouyel
- Fonction : Auteur
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Julie Williams
- Fonction : Auteur
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Wiesje van der Flier
- Fonction : Auteur
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Alfredo Ramirez
- Fonction : Auteur
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Margaret Pericak-Vance
- Fonction : Auteur
Ole A Andreassen
- Fonction : Auteur
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Cornelia van Duijn
- Fonction : Auteur
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Mikko Hiltunen
- Fonction : Auteur
Agustín Ruiz
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1305732
- ORCID : 0000-0003-2633-2495
Josée Dupuis
- Fonction : Auteur
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Eden Martin
- Fonction : Auteur
Jean-Charles Lambert
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Brian Kunkle
- Fonction : Auteur
Céline Bellenguez
- Fonction : Auteur
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- ORCID : 0000-0002-1240-7874
Résumé
Due to methodological reasons, the X-chromosome has not been featured in the major genome-wide association studies on Alzheimer’s Disease (AD). To address this and better characterize the genetic landscape of AD, we performed an in-depth X-Chromosome-Wide Association Study (XWAS) in 115,841 AD cases or AD proxy cases, including 52,214 clinically-diagnosed AD cases, and 613,671 controls. We considered three approaches to account for the different X-chromosome inactivation (XCI) states in females, i.e. random XCI, skewed XCI, and escape XCI. We did not detect any genome-wide significant signals (P ≤ 5 × 10 − 8 ) but identified seven X-chromosome-wide significant loci (P ≤ 1.6 × 10 − 6 ). The index variants were common for the Xp22.32, FRMPD4, DMD and Xq25 loci, and rare for the WNK3 , PJA1 , and DACH2 loci. Overall, this well-powered XWAS found no genetic risk factors for AD on the non-pseudoautosomal region of the X-chromosome, but it identified suggestive signals warranting further investigations.
Domaines
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