Identification d’une signature transcriptomique associée au statut FHITlow/pHER2high
Résumé
Introduction La perte du gène fragile histidine triad (FHIT) est
un évènement fréquent dans les cancers bronchiques non à petites
cellules (CBNPC). Nous avons précédemment montré que FHIT
contrôle l’activité du récepteur HER2 dans les cellules tumorales
pulmonaires et que les cellules tumorales présentant une perte
d’expression de FHIT et une activation consécutive du récepteur
HER2 (pHER2) sont plus sensibles à une thérapie anti-HER2 [1]. Nous
avons cherché à identifier la signature transcriptomique associée au
phénotype FHITlow/pHER2high et à évaluer sa relevance clinique.
Méthodes Nous avons mené une analyse de RNA-sequencing sur
des cellules tumorales isolées de CBNPC présentant ou non un statut
FHITlow/pHER2high. Nous avons ensuite évalué la signature FHITlow/pHER2high dans des cohortes de CBNPC issues du TCGA et
utilisé l’outil informatique tumor immune dysfunction and exclusion (TIDE) de prédiction de la réponse aux inhibiteurs de point de
contrôle immunitaire (ICI) [2].
Résultats Nous avons identifié 983 gènes significativement différentiellement exprimés entre les tumeurs FHITlow/pHER2high et
les autres. Des caractéristiques de prolifération, de réparation de
l’ADN, de métabolisme, de réponse immune et de métastases sont
significativement enrichies dans les tumeurs FHITlow/pHER2high.
Les gènes surexprimés dans ces mêmes tumeurs sont enrichis en
processus de réplication et de réparation de l’ADN et de division
cellulaire. Par contre, les gènes sous-exprimés sont enrichis en
termes de transport, d’adhérence cellulaire, de réponse à divers
stimuli et surtout de réponse immune, plus particulièrement associée au complexe majeur d’histocompatibilité de classe II. Nous
avons confirmé dans des cohortes d’adénocarcinomes et de carcinomes épidermoïdes que le phénotype FHITlow/pHER2high est
plus agressif avec une taille supérieure des tumeurs, la présence
d’un envahissement ganglionnaire et un stade TNM plus avancé.
De plus chez les adénocarcinomes, les tumeurs FHITlow/pHER2high
montrent une survie sans récidive et une survie globale significativement réduites. Enfin, nous avons également mis en évidence que
les tumeurs FHITlow/pHER2high sont de mauvaises répondeuses aux
ICI.
Conclusion Ces résultats suggèrent qu’une thérapie ciblée antiHER2 serait une bonne alternative à l’immunothérapie pour
les patients atteints de CBNPC porteurs d’une tumeur FHITlow/pHER2high.