L'étude de chimiodiversité liée à celle de la biodiversité est le plus souvent envisagée sous l'angle de la caractérisation des métabolites spécialisés (ou secondaires) produits par le vivant. Ces composés sont généralement obtenus au sein de mélanges complexes. Le problème qui pose alors est l'identification structurale des composés organiques en mélange. Une solution apportée à ce problème est la méthode dite "CARAMEL" de CARActérisation de MELanges. Cette méthode repose sur le fractionnement des extraits par chromatographie de partage centrifuge, la spectroscopie de RMN du carbone-13, l'alignement des spectres, la classification hiérarchique ascendante et la recherche des structures connues dans des bases de données. Ces différentes étapes seront détaillées dans un premier temps, avec un accent particulier sur la constitution et l'utilisation d'une base de données généraliste. Dans un deuxième temps, l'analyse automatisée des composés nouveaux par le logiciel « Logic for Structure Determination », LSD, sera abordée.